Desta forma, o conhecimento gerado no âmbito da investigação de excelência no Ispa nestas áreas do conhecimento, em concreto no âmbito do MARE – Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, uma unidade de investigação na área do mar que reúne mais de 400 investigadores de seis universidades portuguesas, recentemente classificada como “Excelente” na última avaliação da Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT), é traduzido num plano de curso centrado para o fornecimento de competências que permitam uma completa e integrada compreensão do funcionamento dos ecossistemas marinhos.

Para além da sólida formação teórica, é preocupação central deste ciclo de estudos o contacto com a prática. O Ispa trabalha há muitos anos em estreita articulação com instituições públicas, empresas e organizações não-governamentais com ação na área da conservação marinha, tendo os estudos de base que justificaram a criação do Parque Marinho Professor Luiz Saldanha no Parque Natural da Arrábida, sido realizados pelo Ispa. Esta componente aplicada da gestão dos ecossistemas marinhos é suportada pelo Centro de Biociências do Ispa, sendo uma mais-valia deste curso quando comparado com outros similares existentes em Portugal permitindo aos estudantes aplicar os seus conhecimentos na prática durante os dois anos de formação do mestrado.